当山は､臨済宗東福寺（とうふくじ）派大本山東福寺の直末（総本山直属の末寺）として､建治二年（1276年）開基（かいき）常陸国（ひたちのくに）守護佐竹常陸介義胤公､開山は東福寺開山円爾弁円大和尚｢勅諡（ちょくし）聖一国師（しょういちこくし）｣により開創されました｡

　東日本大震災で崩壊するまで､松吟寺歴代住職の墓地には円爾弁円｢聖一国師｣の佛塔が残っておりました｡
震災以降は､新しい佛塔に変わっております｡
当時の佛塔は雨で浸食刺され長い歴史を感じさせてくれました｡

　 南山士雲禅師（なんざん しうん）が当山2世住職とされております｡南山士雲禅師は､大本山円覚寺や大本山建長寺の管長をおつとめされており関東に長い期間おりました｡一説によると聖一国師に命ぜられ､実際には､南山士雲禅師が松吟寺の開山に関わったのではという説もあるようです｡

　乾峯士雲（けんぽうしどん）禅師｢廣智国師（こうちこくし）｣が当山3世とされております｡乾峯士雲禅師も2世の南山士雲禅師同様､大本山円覚寺や大本山建長寺の管長をおつとめされております｡

　1656年（明暦2年）､水戸藩主徳川頼房公が御参拝になられ鐘楼を御寄進されました｡
しかし､その鐘楼も戦時中の｢金属供出｣により寺から運び出されてしまいました｡現在は､お檀家様の寄付により平成29年に｢祈りの鐘｣として復活いたしました｡

　明治40年（1907年）廃寺になってから約60年が経過した松吟寺に埼玉県･観音院より喚山哲応和尚が入寺（昭和9年遷化）され復興のための準備を行いました｡哲応和尚は､遷化されるまでの14年間を松吟寺で過ごし､住居兼本堂のような小さな1棟で法務にご尽力されました｡

　 廃寺から復興準備中の松吟寺本堂と庫裡です｡昭和25年まで本堂兼庫裡の画像です｡ﾊﾞﾅﾅの木があり､昭和の50年頃まで残っておりました｡

　 昭和27年（1952年）117年ぶりに本堂を再建しました｡大本山東福寺派第299世管長　晦宗恵鏡（まいじゅうえきょう）大和尚を中興開山（松吟寺初代住職）とし､縣知事より宗教法人｢稲荷山松吟寺｣の認証を受けることができました｡その後､南昌賢童和尚（松吟寺第2世）に引き継がれました｡

　昭和11年（1937年）現･行方市皇徳寺より南昌賢童和尚が入寺（平成8年遷化）されました｡当時は､常陸太田市の正宗寺（円覚寺派）が本寺であり､その末寺にして頂き法務を行っておりました｡賢童和尚は､松吟寺の他に､城里町の霊源寺､常陸太田市の耕山寺､同市の高長寺を兼務し､多忙な日々を送りました｡